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伯豪生物
線下巡講 | 伯豪生物單細(xì)胞生信交流會
發(fā)布時間:2020-11-17 瀏覽次數(shù):8454
為了讓更多老師可以切實了解到單細(xì)胞分析的細(xì)微邏輯思路,伯豪生物單細(xì)胞團(tuán)隊決定匯總分析思路,開展線下交流會。

單細(xì)胞測序憑借自身技術(shù)優(yōu)勢和成熟商業(yè)化逐漸受到廣大科研老師的青睞,幾乎已經(jīng)成為了每個科研課題組的必備品。但單細(xì)胞測序往往會獲得的海量數(shù)據(jù),如何理解并解析單細(xì)胞的數(shù)據(jù),尤其是如何能充分挖掘單細(xì)胞的亞群基因信息,成為很多科研團(tuán)隊迫在眉睫的問題!

伯豪生物一直致力于高通量領(lǐng)域的科研服務(wù),把單細(xì)胞測序作為優(yōu)勢服務(wù)重點進(jìn)行了研發(fā)和創(chuàng)新,尤其是在數(shù)據(jù)分析方面,伯豪生物專業(yè)科研團(tuán)隊與全國各地的多個課題組一起匯總新的單細(xì)胞文章,并摸索算法和分析邏輯,在經(jīng)過了幾十場的線下線上培訓(xùn)后,形成了一系列的單細(xì)胞分析思路。 

為了讓更多老師可以切實了解到單細(xì)胞分析的細(xì)微邏輯思路,伯豪生物單細(xì)胞團(tuán)隊決定匯總分析思路,開展線下交流會。

全方位解析單細(xì)胞,時間地點,會議模式,任您選擇!


模式一:半天精華解析交流會

內(nèi)容包含:

1.  單細(xì)胞測序流程介紹和懸液制備的實驗細(xì)節(jié)、上機(jī)質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)判斷、10X Genomics 和 BD 的捕獲原理,以及自主制備單細(xì)胞懸液經(jīng)常遇到的問題和解決辦法。

2.  單細(xì)胞基因表達(dá)矩陣展示,基礎(chǔ)質(zhì)控和數(shù)據(jù)過濾標(biāo)準(zhǔn)以及 Seurat 聚類原理、分群圖片基礎(chǔ)介紹,亞群注釋原理以及如何進(jìn)行個性化的注釋,從亞群注釋的角度來探析單細(xì)胞 Marker 與流式 Marker 的區(qū)別和聯(lián)系。

3.  單細(xì)胞簡化矩陣的原理以及如何通過共表達(dá)來深入挖掘特定亞群的基因表達(dá)規(guī)律。

4.  單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的邏輯,包括如何解讀 GSEA、擬時序、細(xì)胞間通訊、Scenic、Velocity 的數(shù)據(jù),以及如何從基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析開始逐步拓展到深入挖掘。

5.  單細(xì)胞新技術(shù)應(yīng)用介紹,包括單細(xì)胞表面蛋白測序、單個細(xì)胞核的測序、空間轉(zhuǎn)錄組測序。





模式二:全天全面實操交流會

內(nèi)容包括:

1.  精華解析交流會的所有內(nèi)容,數(shù)據(jù)分析素材交流拷貝。

2.  解讀單細(xì)胞的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)分析流程,附贈部分分析代碼,重點是解析單細(xì)胞基礎(chǔ)分析報告,以及部分個性化實操,內(nèi)容包括 Seurat 聚類實操,亞群 Marker 基因作圖、自主利用公共網(wǎng)站做 Marker 基因的富集分析,附贈亞群比例的聚類熱圖代碼。

3. Loupe 實操,現(xiàn)場演示 10x  公司的單細(xì)胞軟件 Loupe 的多種個性化分析方法,根據(jù)基因信息來個性化提取細(xì)胞信息。

4.  高級分析內(nèi)容實操,包括解讀 GSEA、擬時序的數(shù)據(jù)分析報告、簡化矩陣、細(xì)胞間通訊、InferCNV、Scenic、Velocity 的數(shù)據(jù)。

5.  重點梳理幾篇 CNS 級別的單細(xì)胞分析思路。


會議說明:

●  全國巡講,按報名順序排期,早預(yù)約早安排;

●  半天精華解析交流會人數(shù)不限,全天全面實操交流會每場人數(shù)建議 50 人左右。

●  全天全面實操交流會參會建議自帶筆記本電腦。


參會方式:

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