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伯豪生物
【表觀遺傳聯(lián)合轉(zhuǎn)錄測(cè)序】加油開(kāi)學(xué)季 | 表觀遺傳聯(lián)合轉(zhuǎn)錄測(cè)序大聚惠
發(fā)布時(shí)間:2019-04-16 瀏覽次數(shù):7243
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3999 元 / 樣本

850K 甲基化芯片檢測(cè) &mRNA 測(cè)序服務(wù)

√??? 單個(gè)樣本 mRNA 測(cè)序數(shù)據(jù)量不小于 6G!

√?? 促銷活動(dòng)僅限前 300 個(gè)樣本,先到先得,促完即止!

√?? 合同樣本數(shù)超過(guò) 30 個(gè),立享伯豪生物 R 語(yǔ)言培訓(xùn)班半價(jià)優(yōu)惠!

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伯豪生物甲基化芯片檢測(cè)服務(wù)優(yōu)勢(shì)

√? 質(zhì)優(yōu)價(jià)廉: 伯豪生物擁有多年的甲基化芯片服務(wù)經(jīng)驗(yàn),服務(wù)客戶曾發(fā)表多篇 IF>10 文章,包括 JCO, Nature Communications, Cell Stem Cell 等。

√ 強(qiáng)大的數(shù)據(jù)分析團(tuán) 隊(duì) :伯豪生物擁有一支具有豐富生物信息分析經(jīng)驗(yàn)的工程師隊(duì)伍,人才梯隊(duì)配置合理,項(xiàng)目負(fù)責(zé)人具有大項(xiàng)目分析經(jīng)驗(yàn)(EWAS 項(xiàng)目,Hongsong?Yu,?et?al.?2019),能完成各類高難度高級(jí)分析。

√? 超快的分析周期:? 芯片上機(jī)結(jié)束,拿到數(shù)據(jù)后,2 個(gè)工作日即可完成基礎(chǔ)分析。

√? 極低的樣本起始:?10 年的 FFPE 樣本處理經(jīng)驗(yàn),特殊樣本總量低至 250ng,? 仍可提供完美的解決方案。


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伯豪 mRNA 測(cè)序服務(wù)優(yōu)勢(shì)

√? 樣本處理: 超過(guò) 200 種樣本的 RNA 抽提經(jīng)驗(yàn);易降解樣本、微量樣本的抽提解決方案;

√? 文庫(kù)構(gòu)建: 低至 200ng 起始的建庫(kù)能力,另有單細(xì)胞(微量)測(cè)序解決方案;

√? 質(zhì)控管理:ISO9001 認(rèn)證,Illumina?CSPro 認(rèn)證;

√? 數(shù)據(jù)分析: 學(xué)術(shù)界權(quán)威的算法和流程;全面的分析內(nèi)容;靈活的定制分析;

√? 項(xiàng)目成果: 協(xié)助客戶發(fā)表 116 篇論文,平均 IF>5。


聯(lián)合分析展示

1、熱圖形式展示關(guān)聯(lián)結(jié)果


圖 1 ? 結(jié)合各樣本的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和 CG/CHG/CHH 層面的甲基化數(shù)據(jù),進(jìn)行關(guān)聯(lián)展示,可以直接看出甲基化與基因表達(dá)之間的關(guān)系。

Kawakatsu?T?,?Stuart?T?,?Valdes?M?,?et?al.?Unique?cell-type-specific?patterns?of?DNA?methylation?in?the?root?meristem[J].?Nature?Plants,?2016,?2(5):16058.


2、 散點(diǎn)圖形式展示關(guān)聯(lián)結(jié)果


圖 ?2?? 甲基化與表達(dá)的關(guān)聯(lián)分析。橫坐標(biāo)為組間樣本同一位點(diǎn)的均值△β??v坐標(biāo)代表基因 FPKM 的倍數(shù)差異(可以取 log2)。


3、樣本內(nèi)所有基因的甲基化與表達(dá)的關(guān)聯(lián)結(jié)果展示


圖 ?3? 樣本(或組內(nèi))所有基因的甲基化與表達(dá)的相關(guān)性。橫坐標(biāo)代表基因 FPKM 的倍數(shù)差異(可以取 log2(FPKM+1))。縱坐標(biāo)為基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化程度均值。


4、特定基因?qū)?yīng)不同類型樣本間 RNA 與甲基化的關(guān)聯(lián)展示


圖 ?4?? 不同組的各樣本 CTRC 基因的啟動(dòng)子區(qū)甲基化與 RNA 表達(dá)的關(guān)聯(lián)分析。橫坐標(biāo)為各樣本的基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化程度均值。縱坐標(biāo)代表以 FPKM 代表基因的表達(dá)量。

Anonymous?(2017)?Comprehensive?and?Integrative?Genomic?Characterization?of?Hepatocellular?Carcinoma.?(Translated?from?eng)?Cell?169(7):1327-1341?e1323?(in?eng).


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