scRNA-seq + bulk RNA-seq
一份價(jià)格 - 兩種服務(wù) - 更好結(jié)果
活動(dòng)規(guī)則
簡(jiǎn)述：
單個(gè)項(xiàng)目滿 6 個(gè)樣本及以上； 單細(xì)胞樣本數(shù)等于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序； 合同金額 80% 到款即刻享受。
詳述：
1. 活動(dòng)中單細(xì)胞測(cè)序（scRNA-seq）指的是基于 BD 或 10X 平臺(tái)的單細(xì)胞 RNA 測(cè)序，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序指的是常規(guī) mRNA 測(cè)序（bulk RNA-seq)；
2. 單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目滿 6 個(gè)樣本起送同樣樣本及同樣樣本數(shù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，即單細(xì)胞測(cè)序 6 個(gè)樣本送 6 個(gè)同樣樣本常規(guī) mRNA 測(cè)序，依此類推；
3. 活動(dòng)期限內(nèi)簽訂單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)合同，且預(yù)付 80% 到款后，享受轉(zhuǎn)錄組測(cè)序免費(fèi)服務(wù)；
4. 參與活動(dòng)項(xiàng)目常規(guī) mRNA 測(cè)序數(shù)據(jù)量≤6G/ 樣本；
5. 本活動(dòng)不與伯豪生物其他優(yōu)惠活動(dòng)共享
掃碼參與活動(dòng)
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< 單細(xì)胞測(cè)序 + 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 >
1. 常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以幫助獲得樣本的基本轉(zhuǎn)錄組信息，可以作為單細(xì)胞測(cè)序的預(yù)實(shí)驗(yàn)：
來(lái)自北大張澤民課題組在 2017 年發(fā)表在 cell 上關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序分析肝癌 T 淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)，以及 2019 年發(fā)表在 cell 上關(guān)于肝癌的單一免疫細(xì)胞的動(dòng)態(tài)景觀圖的研究中，除了運(yùn)用 Smart-seq2 和 10X genomeics 技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序之外，還運(yùn)用的 bulk RNA-seq 技術(shù)檢測(cè)了肝癌組織整體的轉(zhuǎn)錄水平，以及初步評(píng)估樣本中細(xì)胞的類別。
2. 兩種測(cè)序結(jié)果相互印證：
來(lái)自 Charmaine 團(tuán)隊(duì)在 2018 年發(fā)表在 cell stem cell 上的關(guān)于 IPSC 誘導(dǎo)多能干細(xì)胞分化的神經(jīng)元的單細(xì)胞測(cè)序的研究中，作者同時(shí)從 PD 病人中分離 IPSC 并誘導(dǎo)分化成多巴胺神經(jīng)元，和從正常人中分離 IPSC 并誘導(dǎo)分化成多巴胺神經(jīng)元。對(duì)分化的神經(jīng)元同時(shí)進(jìn)行了 Smart-seq 的單細(xì)胞測(cè)序，以及 bulk RNA-seq。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，bulk RNA-seq 也可以清楚的發(fā)現(xiàn)，PD 病人和正常人的 IPSC 誘導(dǎo)得到的多巴胺神經(jīng)元在整體轉(zhuǎn)錄水平上存在差異，且這些差異主要集中在與神經(jīng)元發(fā)育和突出活動(dòng)相關(guān)的功能上。
3. bulk RNA 測(cè)序可以襯托單細(xì)胞測(cè)序的優(yōu)勢(shì)：
來(lái)自 li 團(tuán)隊(duì)與 2017 年發(fā)表在 nature genetics 上的關(guān)于結(jié)直腸癌組織和正常粘膜組織的單細(xì)胞測(cè)序研究中，作者展示了單細(xì)胞測(cè)序和 bulk RNA 測(cè)序在篩選差異基因方面的區(qū)別。研究發(fā)現(xiàn)，通過(guò)常規(guī)轉(zhuǎn)組測(cè)序無(wú)法得到的差異基因，而通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序可以發(fā)現(xiàn)這些基因在癌組織和正常組織的特定的細(xì)胞類群中是存在顯著差異的。比如（下圖），與 EMT（上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化）相關(guān)的基因只在成纖維細(xì)胞這個(gè)類群中存在差異。
為什么要選擇：伯豪生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)？
伯豪生物經(jīng)過(guò) 6 年的積累，基于 SMART-seq，10X genomics 和 BD Rhapsody 的單細(xì)胞 RNA 測(cè)序服務(wù)平臺(tái)，為客戶提供從樣本保存、運(yùn)輸、單細(xì)胞懸浮液制備，到單細(xì)胞分選、建庫(kù)、和數(shù)據(jù)分析的一站式解決方案，目前已為來(lái)源于人、小鼠、大鼠、果蠅、斑馬魚、牛、羊等物種的樣本提供了單細(xì)胞測(cè)序和數(shù)據(jù)分析服務(wù)，研究成果發(fā)表在 Cell Research、Nature Neuroscience 等雜志上。
參考文獻(xiàn)
1.Zheng, Chunhong, et al."Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by single-cell sequencing." Cell 169.7 (2017): 1342-1356.）
2.Zhang Q, He Y, Luo N, et al. Landscape and dynamics of single immune cells in hepatocellular carcinoma[J]. Cell, 2019, 179(4): 829-845. e20.
3.Lang, Charmaine, et al."Single-cell sequencing of iPSC-dopamine neurons reconstructs disease progression and identifies HDAC4 as a regulator of parkinson cell phenotypes." Cell stem cell 24.1 (2019): 93-106.）
4.3. Li, Huipeng, et al."Reference component analysis of single-cell transcriptomes elucidates cellular heterogeneity in human colorectal tumors." Nature genetics 49.5 (2017): 708.）
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