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伯豪生物
華大 | 單細(xì)胞 RNA 測序

技術(shù)簡介

DNBelab?C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 文庫制備試劑盒套裝 V3.0 在原版本基礎(chǔ)上完成了全新升級,包括液滴生成儀器 TaiM4,加樣載片,液滴生成試劑,高通量文庫制備試劑和開源的數(shù)據(jù)質(zhì)控分析包來支持全流程的單細(xì)胞測序分析。

DNBelab?C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 文庫制備

技術(shù)原理

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雙磁珠捕獲系統(tǒng):mRNA 捕獲磁珠與液滴識別微珠,提高捕獲效率。

DNBelab C4 平臺是基于微流控技術(shù)原理,通過雙磁珠系統(tǒng)(大磁珠捕獲 mRNA,小磁珠識別大磁珠)精準(zhǔn)識別磁珠多胞、增加捕獲效率。大磁珠捕獲 mRNA 和小磁珠釋放的 Oligo 之后的結(jié)構(gòu)如圖所示,之后 cDNA 的 Oligo 會分開建庫測序,Cell barcode 和 Oligo index 建立 reads- 磁珠 - 細(xì)胞的映射關(guān)系。

儀器平臺

圖片 1

DNBelab C-TaiM 4 單細(xì)胞液滴生成儀;

DNBelab C-TaiM 4 單細(xì)胞液滴生成儀,配備 4 個獨立控制的微流控通路,同時兼容單細(xì)胞 3'RNA 文庫和 ATAC 文庫制備,支持 1~4 樣本靈活上樣,小巧輕便、即開即用,適用于 2.5 千米以下海拔的實驗室環(huán)境。


伯豪優(yōu)勢


1、平臺互補:與 10X Genomics 等平臺的互補,客戶靈活自選。

2、覆蓋度高:測序覆蓋 cDNA 的全長序列,每個細(xì)胞能夠獲得上萬個基因的表達。

3、信息個性化:除了獲得基因表達信息,數(shù)據(jù)能夠用于可變剪接,cSNP 等分析,以及帶 poly- A 結(jié)構(gòu)的 lncRNA 研究。

樣本要求

DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 文庫制備試劑盒開展的研究或應(yīng)用涵蓋的樣本類型豐富,包括人、鼠等 動物和擬南芥、水稻等植物超過 50 個物種的 300 多個組織類型。

 伯豪生物華大設(shè)備單細(xì)胞測序適用樣本類型


技術(shù)參數(shù)


DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 測序

根據(jù)實驗經(jīng)驗表明,人的 PBMC 細(xì)胞、腦細(xì)胞核、脂肪細(xì)胞核、鼠肺癌細(xì)胞等樣本類型的細(xì)胞捕獲效率 >50%,基因檢出均達到 1000 多。


 圖片 3


此外,實驗經(jīng)驗證實,DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 文庫制備試劑盒套裝性能非常穩(wěn)定,平行樣本實 驗結(jié)果具有很高的一致性。

圖 4


案例展示

DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 測序已廣泛應(yīng)用于科學(xué)研究和臨床應(yīng)用,尤其是在腫瘤、微生物、神經(jīng)科學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域均有高分文章發(fā)表。

? 腫瘤 微生物 ? 神經(jīng)科學(xué) ? 免疫學(xué) ?? 其它

案例展示

? 截止 2024 年 5 月,利用 DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 測序技術(shù)進行研究發(fā)表的文章累計 80 多篇,尤其是在 Nature,Cell,Cell Research,Immunity 等國際頂刊也發(fā)表過多篇代表性文章。


文獻案例 1:獼猴全身器官細(xì)胞圖譜

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文章標(biāo)題:Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis

發(fā)表期刊:Nature?

影響因子:64.8?

發(fā)表時間:2022.04?

樣本信息: 獼猴全身 45 種器官或組織 ?

研究摘要: 利用 DNBelab-C4 和 DNBSEO 測序平臺,對食蟹猴的主要組織器官(肺、腎臟、肝、胰腺、大腦、主動脈、甲狀腺、腮腺和血液)進行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,建立了食蟹猴單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,鑒定出 44 種 食蟹猴的主要細(xì)胞類型,在國際上首次完成構(gòu)建非人靈長類單細(xì)胞圖 V1.0,對于新冠藥物和疫苗的研發(fā)具有重要指導(dǎo)作用。


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文獻案例 2:體外誘導(dǎo)獲得人類全能干細(xì)胞

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文章標(biāo)題:Rolling back human pluripotent stem cells to an eight-cell embryo-like stage?

發(fā)表期刊:Nature?

影響因子:64.8?

發(fā)表時間:2022.03?

樣本信息: 人類 8C 期胚胎樣細(xì)胞(8CLC)?

研究摘要: 該研究利用 DNBelab-C4 和 DNBSEQ 測序平臺,對 8CLC 誘導(dǎo)過程的細(xì)胞樣本進行了單細(xì)胞 轉(zhuǎn)錄組(scRNA-seq)和染色質(zhì)可及性(scATAC-seq)測序,詳細(xì)分析了 8CLC 群體的特征,并在多個誘導(dǎo) 時間點描繪了 8CLC 誘導(dǎo)過過程中轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)開放性的動態(tài)變化,為研究人類 8 細(xì)胞期的合子基因 組激活和發(fā)育調(diào)控提供了重要的平臺和資源。

圖片 5


文獻案例 3:最詳盡的人類骨骼肌衰老大細(xì)胞圖譜

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文章標(biāo)題:Multimodal cell atlas of the ageing human skeletal muscle?

發(fā)表期刊:Nature?

影響因子:64.8?

發(fā)表時間:2024.05?

樣本信息: 來著不同性別,不同年齡的 31 個人下肢肌肉骨骼肌 研究摘要:該研究利用單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞核染色質(zhì)開放組技術(shù),結(jié)合組織染色,構(gòu)建了包含 31 個 人(包括 17 名男性和 14 名女性,覆蓋 15-99 歲的人群)下肢肌肉骨骼肌多模態(tài)單細(xì)胞圖譜。通過對 387000 多個細(xì)胞 / 核的深入分析,研究人員詳細(xì)描述了細(xì)胞群體在衰老過程中的變化,包括老年人群 新出現(xiàn)的細(xì)胞群體,以及這些變化背后的細(xì)胞特異性特征和多細(xì)胞間的網(wǎng)絡(luò)互動特性。該研究在轉(zhuǎn)錄 組學(xué)和表觀遺傳學(xué)層面上深入探討了與骨骼肌衰老相關(guān)的分子機制。

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